กัญญาวีร์ (ฮาน่า ลีวิส) ลูกสาวของ ดร.กิตนัย (กลศ อัทธเสรี) อดีตศัลยแพทย์ และวิศวกรเครื่องกลฝีมือดี อาศัยอยู่กับ แม่ขวัญรัตน์ (น้ำทิพย์ เสียมทอง) และ อากานดา (วาเนสซ่า บีเวอร์) วันหนึ่งกัญญาวีร์บังเอิญเข้าไปมีส่วนร่วมกับการจับกุมคนร้ายของ ร้อยตำรวจเอกเตชิต (กันตพงศ์ บำรุงรักษ์) ร้อยตำรวจโทหญิงนัทธมน (ขวัญกวินท์ ธำรงรัฐเศรษฐ์) และ ร้อยตำรวจโทชยธร (รพีภัทร เอกพันธ์กุล) ที่กำลังสืบคดีองค์กรต่อต้านการก่อการร้ายองค์กรหนึ่ง ซึ่งมีหัวหน้าองค์กรคือ พ.ต.ท. พิพัฒน์ (ธีรพงศ์ เหลียวรักวงศ์) อดีตนายทหารนอกราชการ ที่เป็นเครือข่ายของมหาเศรษฐีต่างชาติชื่อ เจสัน พาร์ค (โอริเวอร์ บีเวอร์) เพราะเชื่อว่าองค์กรนี้อยู่เบื้องหลังแผนการชั่วร้าย เมื่อดร.กฤตนัยพ่อของกัญญาวีร์กลับมาจากต่างประเทศ แล้วเจอเตชิตที่มาสอบสวนกัญญาวีร์ที่บ้าน กัญญาวีร์กลัวพ่อเป็นห่วง จึงโกหกว่าเตชิตเป็นแฟน เตชิตรู้ว่าพ่อของกัญญาวีร์ทำงานให้องค์กรของพิพัฒน์ จึงตัดสินใจขอหมั้นกัญญาวีร์เพื่อใช้เธอเป็นสื่อสืบคดีของพิพัฒน์ ทำให้ทั้งสองเริ่มพัฒนาความสัมพันธ์โดยที่ไม่รู้ตัว

นำบุญ (ปราบ ยุทธพิชัย) เพื่อนของดร.กฤตนัยรู้ว่าพิพัฒน์กับเจสันแอบโคลนนิ่งมนุษย์ เพื่อสร้างกองทัพนักฆ่า และเป็นแหล่งผลิตอวัยวะมนุษย์ขายให้กับเศรษฐีที่ต้องการเปลี่ยนถ่ายอวัยวะ โดยไม่สนใจเรื่องมนุษยธรรม นำบุญเตือนดร.กฤตนัยว่าองค์กรที่เขาเชื่อมาตลอดว่าเป็นองค์กรของรัฐที่สร้างมาเพื่อความมั่นคงของประเทศ แท้จริงเป็นองค์กรของเหล่าร้าย ดร.กฤตนัยรับไม่ได้จึงขอลาออก พิพัตน์จึงส่ง วรมัน (วาทิต โสภา) มือสังหารชีวกลไปจัดการดร.กฤตนัย และสร้างสถานการณ์ให้รถประสบอุบัติเหตุ โดยมี ธรณ์เทพ (เวนช์ ฟอลโคเนอร์) พ่อของเตชิตร่วมแผนการ พรเทพต้องการอวัยวะของขวัญรัตน์ไปให้กับ ปราง (ดวงพร สนธิขันธ์) ภรรยาหรือแม่ของเตชิตที่กำลังจะตาย โดยเตชิตไม่เคยรู้เลยว่าพ่อของตนเองมีส่วนร่วมกับองค์กรร้าย และยังให้ ฉัตรรัศมี (คีตภัทร แวนดิว) น้องสาวติดพ่อ ที่เตชิตเข้าใจมาตลอดว่าเป็นน้องสาวแท้ ๆ ร่วมแผนการร้าย เหตุการณ์นี้ทำให้ขวัญรัตน์เสียชีวิต ส่วนกัญญาวีร์อาการโคม่าและเสียชีวิตในที่สุด เตชิตเสียใจจนแทบจะขาดใจตายตามกัญญาวีร์ไป

ดร.กฤตนัยเสียใจที่เป็นต้นเหตุทำให้เกิดเหตุการณ์นี้ขึ้น นำบุญจึงใช้วิทยาการที่ตนคิดค้นขึ้น ปลุกชีวิตกัญญาวีร์ขี้นมาใหม่ให้เป็นมนุษย์กึ่งชีวกล แต่ความทรงจำเก่าของเธอหายไปทั้งหมด จึงเปลี่ยนชื่อใหม่จากกัญญาวีร์เป็น ณัฐวรา มีน้องสาวชื่อ นิรมล (พรชดา เครือคช) นำบุญบรรจุโปรแกรมเข้าไปในตัวของณัฐวรา ให้เธอเป็นหนึ่งในทีม เพชรกุหลาบ ประกอบด้วย กัญญาวีร์, สิตางค์ (ณัฐนันท์ นารี), เด่นเดือน (อาชล เลา), ดุจดาว (อิงฟ้า เกตุคำ) ทำหน้าที่สายลับ และหน่วยสังหารต่อกรกับมนุษย์โคลนนิ่ง และองค์กรร้ายของพิพัฒน์กับเจสัน ทุกคนให้ณัฐวราเป็นหัวหน้าทีม เพราะเธอแข็งแกร่ง มีความสามารถมากที่สุด โดยไม่มีใครรู้ว่าเธอคือมนุษย์กึ่งชีวกล